Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms