Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PdgfaP20033 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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PdgfaP20033 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PdgfaP20033 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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