Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl13aP19253 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms