Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnnc1P19123 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnnc1P19123 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms