Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P18532 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18532 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18532 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18532 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18532 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
P18532 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
P18532 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
P18532 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18532 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18532 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18532 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18532 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18532 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18532 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18532 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18532 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18532 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18532 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18532 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18532 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18532 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
P18532 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms