Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
P18530 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
P18530 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
P18530 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P18530 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms