Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18526 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18526 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P18526 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P18526 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18526 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18526 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P18526 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18526 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18526 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18526 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18526 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18526 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18526 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18526 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18526 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18526 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18526 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18526 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18526 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18526 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18526 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18526 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18526 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18526 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18526 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18526 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18526 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18526 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
P18526 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
P18526 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
P18526 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms