Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata1P17679 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata1P17679 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gata1P17679 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms