Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnc1P15388 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms