Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-D1P14427 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms