Protein–RNA interactions for Protein: P14206

Rpsa, 40S ribosomal protein SA, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpsaP14206 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpsaP14206 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpsaP14206 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RpsaP14206 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RpsaP14206 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms