Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rb1P13405 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rb1P13405 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms