Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms