Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Defa1P11477 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms