Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lamp1P11438 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lamp1P11438 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms