Protein–RNA interactions for Protein: P09926

Surf2, Surfeit locus protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf2P09926 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf2P09926 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf2P09926 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf2P09926 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf2P09926 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf2P09926 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf2P09926 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf2P09926 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf2P09926 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf2P09926 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms