Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa6P09092 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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