Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NefmP08553 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NefmP08553 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NefmP08553 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NefmP08553 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NefmP08553 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NefmP08553 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NefmP08553 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NefmP08553 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NefmP08553 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NefmP08553 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NefmP08553 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NefmP08553 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NefmP08553 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefmP08553 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefmP08553 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefmP08553 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefmP08553 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefmP08553 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefmP08553 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefmP08553 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NefmP08553 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefmP08553 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefmP08553 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefmP08553 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefmP08553 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefmP08553 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefmP08553 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefmP08553 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefmP08553 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NefmP08553 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefmP08553 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefmP08553 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefmP08553 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefmP08553 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefmP08553 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefmP08553 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefmP08553 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefmP08553 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefmP08553 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefmP08553 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefmP08553 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefmP08553 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefmP08553 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefmP08553 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefmP08553 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefmP08553 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefmP08553 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefmP08553 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NefmP08553 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefmP08553 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefmP08553 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefmP08553 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefmP08553 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefmP08553 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefmP08553 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefmP08553 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefmP08553 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefmP08553 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NefmP08553 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefmP08553 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefmP08553 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefmP08553 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefmP08553 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefmP08553 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NefmP08553 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefmP08553 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefmP08553 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefmP08553 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NefmP08553 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefmP08553 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefmP08553 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefmP08553 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefmP08553 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefmP08553 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefmP08553 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefmP08553 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefmP08553 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefmP08553 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefmP08553 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NefmP08553 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefmP08553 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefmP08553 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefmP08553 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefmP08553 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefmP08553 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefmP08553 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefmP08553 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefmP08553 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefmP08553 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefmP08553 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefmP08553 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefmP08553 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NefmP08553 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NefmP08553 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NefmP08553 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NefmP08553 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NefmP08553 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NefmP08553 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NefmP08553 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms