Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col4a2P08122 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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