Protein–RNA interactions for Protein: P06880

Gh1, Somatotropin, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gh1P06880 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gh1P06880 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gh1P06880 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms