Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Apoa4P06728 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apoa4P06728 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms