Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06336 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P06336 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P06336 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06336 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06336 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06336 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06336 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06336 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06336 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06336 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06336 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06336 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06336 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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P06336 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06336 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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