Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-Eb1P04230 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-Eb1P04230 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms