Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lamc1P02468 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lamc1P02468 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms