Protein–RNA interactions for Protein: P01807

Ig heavy chain V region X44, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01807 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01807 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01807 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01807 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01807 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01807 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01807 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01807 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01807 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01807 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01807 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01807 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01807 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01807 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01807 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01807 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01807 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01807 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01807 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01807 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01807 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01807 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01807 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01807 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01807 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01807 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01807 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01807 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01807 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01807 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01807 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01807 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms