Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01747 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01747 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01747 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01747 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01747 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01747 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01747 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01747 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01747 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms