Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01668 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01668 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01668 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01668 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01668 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01668 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01668 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01668 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01668 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms