Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01655 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P01655 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01655 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01655 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01655 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01655 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01655 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01655 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01655 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01655 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01655 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms