Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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P01649 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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P01649 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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P01649 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01649 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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P01649 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01649 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01649 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01649 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01649 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01649 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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P01649 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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P01649 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01649 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01649 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P01649 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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P01649 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P01649 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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P01649 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P01649 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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