Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifnb1P01575 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms