Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dll3O88516 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dll3O88516 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dll3O88516 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dll3O88516 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms