Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec11aO88200 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec11aO88200 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms