Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psma3O70435 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psma3O70435 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms