Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb5O70309 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms