Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lnx1O70263 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lnx1O70263 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms