Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ldb2O55203 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb2O55203 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.1 ms