Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja1O55176 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja1O55176 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja1O55176 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja1O55176 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja1O55176 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja1O55176 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja1O55176 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja1O55176 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja1O55176 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja1O55176 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja1O55176 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pja1O55176 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pja1O55176 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pja1O55176 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pja1O55176 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pja1O55176 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pja1O55176 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms