Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg2O55111 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms