Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrxO55103 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrxO55103 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrxO55103 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrxO55103 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrxO55103 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrxO55103 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrxO55103 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrxO55103 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrxO55103 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PrxO55103 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrxO55103 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrxO55103 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrxO55103 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrxO55103 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrxO55103 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrxO55103 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PrxO55103 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PrxO55103 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrxO55103 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrxO55103 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrxO55103 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrxO55103 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrxO55103 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrxO55103 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrxO55103 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrxO55103 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrxO55103 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrxO55103 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PrxO55103 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PrxO55103 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PrxO55103 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PrxO55103 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PrxO55103 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PrxO55103 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrxO55103 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PrxO55103 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrxO55103 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrxO55103 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PrxO55103 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PrxO55103 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PrxO55103 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrxO55103 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrxO55103 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrxO55103 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PrxO55103 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrxO55103 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
PrxO55103 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PrxO55103 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PrxO55103 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PrxO55103 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms