Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BckdkO55028 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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