Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1bO55017 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms