Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Socs5O54928 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms