Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2f6O54917 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2f6O54917 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2f6O54917 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms