Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffbO54788 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffbO54788 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DffbO54788 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DffbO54788 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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