Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DffaO54786 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DffaO54786 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DffaO54786 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DffaO54786 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DffaO54786 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DffaO54786 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms