Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Limk2O54785 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limk2O54785 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Limk2O54785 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Limk2O54785 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms