Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FxnO35943 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FxnO35943 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FxnO35943 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FxnO35943 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FxnO35943 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FxnO35943 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FxnO35943 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FxnO35943 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FxnO35943 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FxnO35943 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FxnO35943 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FxnO35943 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FxnO35943 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FxnO35943 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FxnO35943 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FxnO35943 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FxnO35943 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FxnO35943 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FxnO35943 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FxnO35943 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FxnO35943 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FxnO35943 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FxnO35943 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FxnO35943 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FxnO35943 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FxnO35943 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FxnO35943 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FxnO35943 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FxnO35943 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FxnO35943 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FxnO35943 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FxnO35943 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FxnO35943 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FxnO35943 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FxnO35943 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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FxnO35943 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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