Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Nek2O35942 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Nek2O35942 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Nek2O35942 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Nek2O35942 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Nek2O35942 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Nek2O35942 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Nek2O35942 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek2O35942 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Nek2O35942 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek2O35942 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nek2O35942 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek2O35942 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms