Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnnd2O35927 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms