Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pik3cdO35904 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pik3cdO35904 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms